医药工程学院立足医工交叉特色，聚焦生物医药领域科技创新与成果转化，持续完善科研硬件设施、搭建高端创新平台、培育优质科研团队，构建了体系完善、特色鲜明的省市级科研创新支撑体系，有力支撑学科建设、科研攻关、人才培养与地方医药产业发展。

学院科研硬件保障雄厚，现有教学实验用房2000余平方米、科研专用用房1000平方米，配备各类实验仪器设备1500余台/套，设备总值2500余万元，可全面满足药物合成、药效验证、纳米医药、生物传感、合成生物等多领域的基础实验与高端科研需求。

依托完备硬件条件，学院累计获批10个省市级科研平台与创新团队，产学研特色鲜明。拥有山东省医工智融基因药物未来产业工程研究中心、山东省高等学校合成生物与新质美妆校企产学研协同创新中心、济宁市医工药协同创新转化重点实验室、山东省重大动物疫病新兽药创制工程研究中心（校企共建）四大核心科研平台；组建山东省高校青创人才引育创新团队、山东省青年科技人才托举工程团队、济宁市科技创新重点团队、济宁市蓼河领军团队等高层次创新梯队，形成“平台托举科研、团队赋能创新”的发展格局，深度推进校企协同与成果转化。

高端科研平台与人才梯队驱动成果高质量产出。学院先后获省级教学成果二等奖2项、省高校科技奖二等奖1项、三等奖3项；近五年承担国家及省部级科研项目31项，科研经费超1000万元；授权国家发明专利9项，完成科技成果转化13项，在多个国际顶级期刊发表高水平SCI论文140余篇，科研创新实力突出。

学院坚持科教融汇、科研育人，全面开放科研平台资源，搭建本科生、研究生创新实践载体，有效助力学生科创竞赛与学术研究，持续提升育人质量。未来，学院将持续深耕医工交叉优势，提质升级科研平台能级，强化科技创新与产业服务能力，对接区域生物医药产业发展需求，为学校高水平医科大学建设赋能增效。