| 省级重点学科一览表 | ||||
| 序号 | 名称 | 批准单位 | 批准日期 | 负责人 |
| 1 | 病理学与病理生理学 | 山东省教育厅 | 2011年6月 | 崔 文 |
| 2 | 神经病学 | 山东省教育厅 | 2011年6月 | 郝延磊 |
| 3 | 免疫学 | 山东省教育厅 | 2011年6月 | 司传平 |
| 4 | 神经内科 | 山东省卫生厅 | 1997年8月 | 张爱梅 |
| 5 | 心血管疾病诊疗中心 | 山东省卫生厅 | 2003年11月 | 闫 波 |
| 6 | 中西医结合临床 | 山东省卫生厅、中医药管理局 | 2013年12月 | 孙 冰 |
校级重点学科一览表
| 序号 | 名称 | 批准单位 | 批准日期 | 负责人 |
| 1 | 心脏外科学 | 济宁医学院 | 2009年12月 | 武广华 |
| 2 | 精神病与精神卫生学 | 济宁医学院 | 2009年12月 | 李功迎 |
| 3 | 医学免疫学 | 济宁医学院 | 2009年12月 | 司传平 |
| 4 | 骨科学 | 济宁医学院 | 2009年12月 | 孟纯阳 |
| 5 | 医学影像学 | 济宁医学院 | 2009年12月 | 马奎元、陈东风 |
| 6 | 药理学 | 济宁医学院 | 2009年12月 | 辛 勤 |